TPA WAPENA secara resmi dibentuk sebagai lembaga otonom secara administrasi dan kepengurusan
dari induk organisasi WAPENA pada Oktober 2009 atas kesepakatan dan prakarsa bersama pengurus
dan warga WAPENA. Prakarsa ini merupakan refleksi pandangan WAPENA bahwa pendidikan ke-Islaman
putra-putri warga WAPENA adalah salah satu amanat terpenting yang disandang WAPENA.

TPA - WAPENASebagai implementasi dari kesepakatan tersebut, telah terbentuk Dewan Pengurus dan Pengajar yang diketuai oleh Ustaz Dr. Nanang Fakhruddin dan dilanjutkan oleh Ustaz Dr. Iskhak Fatonie. TPA WAPENA hadir dengan sistem dan kurikulum yang telah disempurnakan dengan mengadopsi dari beberapa sekolah
Islam/pesantren modern yang berada di Indonesia.

Pada saat ini, TPA WAPENA terdiri dari tiga kelas yaitu TPA Satu (santri berusia 4-6 tahun), TPA Dua (santri berusia 7-11 tahun) dan TPA Remaja (santri berusia 12 keatas). Jumlah keseluruhan santri yang belajar di TPA WAPENA berjumlah lebih dari 30 orang.

Kami sadar bahwa kunci keberhasilan TPA WAPENA ini juga sangat ditentukan dengan terbangunnya komunikasi serta kerjasama yang baik antara Dewan Pengurus dan Dewan Pengajar TPA WAPENA, santri dan wali santri. Untuk itu, Dewan Pengajar memberikan kartu laporan belajar santri agar para wali santri
dapat memonitor perkembangan santri dalam memahami ajaran-ajaran agama yang didapat dari TPA WAPENA.

Adapun beberapa kegiatan yang telah dilaksanakan sejak berdirinya TPA WAPENA antara lain adalah evaluasi belajar santri (ujian lisan dan tulisan) yang dilanjutkan dengan laporan evaluasi santri (rapor), revitalisasi perpustakaan TPA WAPENA yang saat ini mempunyai koleksi lebih dari 60 buku
dan alat peraga lainnya. Tauhid Camp yang merupakan sarana kegiatan untuk menambah wawasan ke-islaman yang intensif dilakukan selama dua hari satu malam, Tadabbur alam adalah kegiatan yang bertujuan untuk mensyukuri nikmat yang diberikan Allah swt kepada makhluknya dengan diisi kegiatan
diluar ruangan, khataman Al Qur’an untuk TPA Remaja, penyaluran jiwa seni para santri dengan
mempelajarai seni teater, seni musik, seni puisi dan Nasyid Islami, dan pemutaran film tentang kisah-
kisah Islami serta ajaran-ajaran Islam lainnya.

Pada tahun ajaran 2011-2012, formasi Dewan Pengajar adalah Ustaz Muhammad Zuhri Catur Candra, Ustaz Yaser Alfarisi (Ais), Ustaz Anggun Saputra dan Ustazah Sanita Suhartono (Nita). Adapun beberapa ustaz yang telah membantu mengajar sejak berdirinya TPA WAPENA adalah: Ustaz Dr. Nanang Fakhruddin, Ustaz Dr. Iskhak Fatonie, Ustaz Dr. Rangga AlMahendra, Ustazah Hanum Salsabilah, Ustaz Keni Vidilaseris, Ustazah Afia Rifkiani, Ustazah Mutia Zahra, Ustaz Dr. Dudy dan Ustazah Dr. Yasinta.